تمنح كلية الهندسة عددا من البرامج الأكاديمية والبرامج المهنية في 14 قسم علميا بالإضافة الى برامج الدراسات العليا الخاصة

1. قسم الھندسة المعمارية 
2. قسم الھندسة الانشائية 
3. قسم ھندسة الرى والھيدروليكا 
4. قسم ھندسة المواصلات
5. قسم الھندسة الصحية 
6. قسم الھندسة الميكانيكية
7. قسم ھندسة الانتاج 
8. قسم الھندسة البحرية وعمارة السفن
9. قسم ھندسة الغزل والنسيج
10. قسم الھندسة الكھربية
11. قسم ھندسة الحاسب والنظم
12. قسم الھندسة النووية والإشعاعية
13. قسم الھندسة الكيميائية 
14. قسم الرياضيات والفيزياء الھندسية