تم إنشاء قسم الهندسة النووية فى عام 1963 وتخرجت أول دفعة من القسم فى عام 66/67 وفى عام 2004 تم تغيير اسم القسم الى قسم الهندسة النووية والإشعاعية وتم تعديل المناهج لتواكب التطور العلمى فى مجال استخدام النظائر المشعة وتطبيقاتها الصناعية والاخطار البيئية المصاحبة لهذا التطور.